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综合司（移民事务国际合作司）
主要职责：负责机关文电、公务、机要、档案、督查督办、安全保密和信访等工作。组织实施审计工作。承担移民领域国际合作与交流。
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政策法规司
主要职责：开展移民和出入境管理政策研究，起草相关法律法规草案。指导移民和出入境执法以及行政复议应诉、国家赔偿、普法宣传工作。
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外国人管理司
主要职责：组织实施外国人来华口岸签证签发管理、签证延期换发。组织实施外国人来华留学管理、停留居留管理、外国人来华工作有关管理事宜。承担外国人来华定居审批管理工作。承担难民身份甄别及临时安置、遣返工作。承担非法入境、非法居留、非法就业外国人治理和非法移民遣返的具体协调工作。
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公民出入境管理司
主要职责：组织实施中国公民因私出入境管理、港澳台居民回内地（大陆）定居审批管理工作。承担国籍审批管理工作。
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边防检查管理司
主要职责：组织实施出入境边防检查、边民出入境检查、临时入境许可和边境地区出入境通行证签发管理。组织指导边境地区边防管理工作。组织实施边控工作。
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信息科技司
主要职责：拟订全国移民管理机构信息化建设规划、技术标准并组织实施。组织开展有关重大信息科技项目开发、推广和安全运行管理。承担政务信息化工作。
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干部人事司
主要职责：指导管理所属队伍党的建设、组织建设、思想政治工作。贯彻实施编制管理的方针政策，组织干部人事调配工作。组织实施表彰奖励、新闻宣传工作。组织开展队伍教育训练。组织实施督察工作。
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后勤保障司
主要职责：负责局本级及所属机构的预决算、财务管理、政府采购工作。组织实施有关基本建设、物资装备、资产管理等工作。
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机关党委
主要职责：负责局机关和在京直属单位的党群工作。配合驻公安部纪检监察组开展局本级及所属机构的纪检监察工作。
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出入境管理信息技术研究所
主要职责：负责协助开展出入境管理科技发展战略研究，开展信息网络、证件、技术装备等重点领域应用技术研究；承担重大科技项目、业务核心软件、关键技术装备研发、建设任务，并开展相关咨询工作；承担国家移民和出入境管理相关信息、通信系统运行维护工作；管理电子出入境证件密钥及关键设备；承担移民和出入境技术、装备、设施的安全质量监督、检测工作；开展出入境证件司法鉴定及服务工作，为国家移民管理系统提供证件鉴别凯发k8国际的技术支持；承担移民和出入境领域科技人才培养，承办相关技术培训和对外交流合作。
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移民事务服务中心
主要职责：负责指导推动社会组织、基层组织和涉外企事业单位等开展来华移民定居人员语言、文化培训辅导，促进移民社会融入；组织编印制作面向来华移民定居人员的法律、文化、社会、国情知识读本和视听资料，帮助熟悉适应工作、生活环境；开展国家移民管理政策法律宣传咨询，协助主管部门开展移民管理国际合作交流，服务引进外国人才和智力工作；收集分析国内外移民情况、特点、趋势，提出移民管理政策法规修订调整建议；了解掌握来华移民定居人员意见建议，协助相关主管部门改进服务管理工作；加挂“中国移民管理报社”牌子，编辑出版发行移民管理报纸、期刊，建设维护网络媒体。
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警务保障中心
主要职责：负责本级和机关委托管理的后勤保障、物业管理和生活服务等工作；承担垂直管理机构来京公务人员的差旅服务协调保障；承担机关委托管理的行政事务性工作；承担机关保卫任务。